秭归县地理坐标为东径110°18′-111°0’，北纬30°38′-31°11’。东与宜昌县的三斗坪、太平溪、邓村交界，南同长阳的榔坪、贺家坪接壤，西邻巴东县的信陵、平阳坝、茶店子，北接兴山县的峡口、高桥。东南至太阳坪，与宜昌、长阳接壤；东北至五指山，与宜昌、兴山接壤；西南至香炉山，与巴东、长阳县接壤；西北至羊角尖，与巴东、兴山接壤。东西最大距离66.1千米，南北最大距离为60.6千米。秭归为大巴山、巫山余脉和八面山坳合地带。长江流经巴东县破水峡入境，横贯县境中部，流长64千米，于茅坪河口出境，把秭归分为南北两部，构成独特的长江三峡山地地貌。境内地形起伏，层峦叠峰，地势为四面高，中间低，呈盆地形。东部边境扇子山海拔1920米；南部边境云台荒海拔2057米（县境最高峰），茅坪河口海拔40米（县境最低点）。
